PyMol軟件

PyMol軟件是一款由使用者贊助的分子三維結構顯示軟件，專門為需要的用戶朋友帶來非常方便的行業3d模型制作軟件，不僅具有豐富的功能更有各種小工具帶來極大的方便，它是是第一個擁有高速光線追蹤器的全功能分子圖像程序，便捷的操作方式加上適合于各種不同的操作系統更有強大的兼容里更新以及全面的繪圖等你來加入，軟件功能多多上手容易值得一試。

PyMol介紹

PyMOL是一款相當優秀的三維分子模型軟件，軟件能夠用戶提供全面的分子可視化系統。使用其集成的光線跟蹤圖形技術，它可以渲染具有更平滑的表面邊界，增強的陰影和反射效果的3D分子結構。軟件支持多種圖像格式，包括PDB，SDF和電子密度圖。

PyMol安裝教程

Window系統的pymol運行需要依賴python環境，PMW模塊。

而Pymol的安裝是通過一個python包（Python Wheels）安裝的，因此在開始之前，我們需要根據系統的位數（32位還是64位）以及python的版本來選擇pymol包進行下載。

比方說，系統是windows 64位，系統中有python 3.7（或者打算安裝python 3.7），那么我們就可以有2個選擇，可以選擇下載pymol-2.3.0-cp37-cp37m-win_amd64.whl或者pymol-2.4.0a0-cp37-cp37m-win_amd64.whl，對應的版本分別是pymol 2.3和pymol 2.4.

如果有更新的pymol包

好了，背景已經介紹完了，現在進入實操。

使用方法

1、點一下菜單欄里邊的便捷標志，就可以進到手機軟件的主界面；
2、進到手機軟件的主界面，能夠對必須應用的功能開展迅速的挑選；
3、對萊單功能開展迅速的顯示，讓你能迅速的搜索到您必須的應用到的功能；
4、支持應用鍵盤快捷鍵來進行相關的黏貼、裁切、拷貝等功能；
5、根據蛋白質編碼序列的實際操作；
6、對原子對開展相關的比照實際操作；
7、對各種各樣您必須的間距、視角等進行測算；
8、對二尾結果的圖型開展迅速的顯示；
9、能夠對相關的立體式實際效果開展迅速的顯示查詢；
10、對光源開展迅速的跟蹤；
11、對靜電感應結構力學開展迅速的檢測；
12、支持對電腦鼠標的相關操作過程開展迅速的查詢閱讀文章；
13、能夠對相關的功能開展迅速的設定，而且對信息內容的顯示；
14、支持對圖形的曲線圖相關信息內容顯示；
15、圖型的顯示是非常的形象化；
16、全方位的程序包的3D渲染和動漫的3d構造；
17、一個置入軟件3d圖象和動漫ppt演試；

PyMol特點

1、提供了強大實用的繪圖工具

2、PyMOL支持多種圖像格式，包括PDB、SDF

3、生成的PyMOL結構可以導出到VRML

4、PyMOL可以使用各種圖像表示方法顯示分子數據

5、具有可定制的顏色，結構標簽，可調對象透明度，輸出和控制大小，自動縮放，文本覆蓋和可定制的鼠標控件

PyMol優勢

擁有相當統一的用戶現代化操作窗口

而且該軟件的接口可以對TCL、TK的平臺上使用

并且對原來的接口進行取代

分布的方式比較的直觀，讓用戶可以清晰的查看到您需要的內容

兼容性比較的強，對各種第三方的插件支持

自定義完成對腳本的支持

可以對可是執行的文件進行快速的開放

安裝python環境

1.0     如果系統中已經有了python環境，則跳過這一步。可以通過命令行：python –V來查看python的版本號。

1.1     進入python官網下載windows版的安裝包

1.2     注意的是下載的安裝包要和windows系統位數對應，x86對應的是32位系統；x86-64對應的是64位系統，我們就以python 3.7為例，由于我們的系統是64位的，所以下載的安裝包為：Windows x86-64 executable installer

1.3     下載完成后，雙擊進行安裝，記得勾選上Add Python to environment variables，不然后續命令行操作會出現問題。

1.4     如果安裝成功，Win+R，cmd進入命令行，鍵入python –V就可以看到python的版本號，同時也說明安裝成功。如果報錯“python不是內部或外部命令，也不是可運行的程序或批處理文件。”那么說明python的地址沒有加入環境變量。

2. 安裝PMW

命令行鍵入：python -m pip install pmw

提示說成功安裝pmw，Successfully installed pmw-2.0.1

3. 下載并安裝pymol包

3.1 根據系統位數和python版本選擇某個pymol包進行下載，放在某個磁盤根目錄。在這里，我們選擇安裝pymol-2.3.0-cp37-cp37m-win_amd64.whl，并放在D:/根目錄。

3.2 命令行下，將盤符切換到D:盤，鍵入命令：python -m pip  install pymol-2.3.0-cp37-cp37m-win_amd64.whl

提示安裝成功

4.完成，找到pymol主程序的位置

 本文中pymol的主程序地址為：C:\Users\Python37\Scripts\pymol.exe

其中紅色背景部分應該會與不同電腦設置及python版本相一致。

最終pymol打開的效果圖：

以上便是WinWin7給大家分享的PyMol軟件！