FlowJo(流式細(xì)胞分析軟件)

FlowJo 10是一款非常不錯的流式細(xì)胞數(shù)據(jù)分析軟件，擁有非常強大的數(shù)據(jù)處理和分析功能，通過圖像分析細(xì)胞的各種變化，結(jié)合細(xì)胞模型創(chuàng)建合理的數(shù)據(jù)分析平臺，支持參數(shù)導(dǎo)出功能，可以兼容幾乎所有流式儀器采集的數(shù)據(jù)，幫助用戶輕松了解了解細(xì)胞的狀態(tài)變化！

軟件特色

1、階梯式設(shè)門

FlowJo獨特的階梯式設(shè)門試一次革命性的創(chuàng)新。他一改傳統(tǒng)復(fù)雜的邏輯門設(shè)置，將細(xì)胞群之間的邏輯關(guān)系用簡單的遞進階梯式去呈現(xiàn)，并可以自定義細(xì)胞群名稱、進而直觀的現(xiàn)實細(xì)胞群統(tǒng)計值，讓分析結(jié)果一目了然，簡單清晰。

2、圖像呈現(xiàn)法

①多維參數(shù)顯示

FlowJo提供了靈活的數(shù)據(jù)呈現(xiàn)方式，全方位滿足用戶的數(shù)據(jù)分析需要。它可以呈現(xiàn)一維的直方圖，傳統(tǒng)的二維圖形，及動態(tài)立體的三維圖形，從多個角度和空間對數(shù)據(jù)進行360°的靜態(tài)以及動態(tài)解析。

②多種圖形類型

FlowJo除了提供傳統(tǒng)的散點圖，還提供多種圖形類型（如密度圖，等高圖，偽色圖，斑馬圖等），在滿足不同分析需求的同時還保證了圖像的美觀和科學(xué)嚴(yán)謹(jǐn)需求。

3、多種設(shè)門工具

設(shè)門是流失數(shù)據(jù)分析中界定細(xì)胞目標(biāo)群的必要手段，不管要檢測的目標(biāo)細(xì)胞群是規(guī)則分布還是不規(guī)則分布，小概率事件還是大概率事件，F(xiàn)lowJo提供了多種設(shè)門工具，從而讓用戶方便的界定各種細(xì)胞群。

4、強大的批量處理功能

用戶可以做一個樣品的門分析，然后將這個分析批處理應(yīng)用到其他樣品上；也可以做一個樣品的圖形分析，然后將這個分析批處理用到其他樣品上。這樣避免了對每一個樣品進行重復(fù)性試驗的分析，即保證了數(shù)據(jù)分析的一致性及靈活性，同時也極大地提高了分析的效率并且得到完美的分析結(jié)果。

①門的批處理

你可以將一個樣品的門分析，批量應(yīng)用到其他的樣品上。整個過程只需要輕輕拖動鼠標(biāo)就可完成，非常簡單。

②圖形分析的批處理

圖像處理也可以用批量分析的方法，將一個樣品的分析應(yīng)用到其他樣品上。

5、多種分析平臺及工具

FlowJo自身包含了多個特殊的分析平臺來滿足細(xì)胞周期，細(xì)胞增殖，動力學(xué)（鈣離子流量）等的分析。這些平臺采用權(quán)威的已發(fā)表的模型算法原理設(shè)計，來精確模擬數(shù)據(jù)分布。FlowJo還包含了多種獨特的分析工具，如數(shù)據(jù)聯(lián)結(jié)、衍生參數(shù)軸、校準(zhǔn)、Backgating、Show Ancestry、Sample Comparision等，讓你對數(shù)據(jù)作進一步的深層分析及處理。

6、熒光補償

熒光補償是六十分析里面一個重要的概念也是一個復(fù)雜的過程，卻是流式分析必不可缺的部分。軟件補償一改過去在機器上手動調(diào)節(jié)補償?shù)娜唛L復(fù)雜過程，大大簡化了熒光補償過程，將補償數(shù)據(jù)的過程變成一個可理解，可見的簡單過程，同時提供了在機器上手動補償所沒有的精確度和靈活性。

7、靈活方便的數(shù)據(jù)導(dǎo)出

數(shù)據(jù)的導(dǎo)出在FlowJo里面非常的輕松方便。不管是圖形數(shù)據(jù)還是數(shù)據(jù)表格，都可以方便的導(dǎo)出成各種格式用來做數(shù)據(jù)的分享和發(fā)表。

軟件功能

1、反向控制分析

一旦你的分析包含了門內(nèi)門控產(chǎn)生的亞群，就可以看到一個給定亞群的源圖形。反向控制分析顯示在每個階段的圖突出最后亞群的每個門控操作圖。

2、抗體面板向?qū)?/p>

這個逐步的工具包含了許多供應(yīng)商的抗體目錄和你的流式細(xì)胞儀的配置，使抗體面板設(shè)計更精簡的過程。它有一個在線網(wǎng)站，fluorish.com，在那里你可以與你的核心或?qū)嶒炇医?jīng)理或同事聯(lián)系，得到儀器的配置，搜索組抗體，抗體和購買。

3、細(xì)胞周期分析

軟件有一個細(xì)胞周期的平臺，采用多種模型對數(shù)據(jù)進行擬合，擬合參數(shù)的約束，并自動計算在G1期，細(xì)胞的百分比，或G2期。所有的模型都可以復(fù)制到其他的人群或樣本中，使用相同的簡單的拖放界面來傳播其他的門或分析。

4、補償

污漬的光譜重疊處理補償工具在軟件。計算補償矩陣的接口是基于單染色控制樣本的集合。然后您可以將這個補償矩陣應(yīng)用到多染色的樣本中。軟件增加了補償參數(shù)多染色樣品，這樣你就可以查看和分析補償數(shù)據(jù)。

5、導(dǎo)出參數(shù)

軟件讓你定義為樣本的新參數(shù)。這些可能包括縮放參數(shù)（擴展感興趣區(qū)域），時間參數(shù)（用于執(zhí)行動力學(xué)分析），比率參數(shù)，或在log和線性縮放之間轉(zhuǎn)換的參數(shù)。派生參數(shù)定義可以復(fù)制到整個組的樣本中。

6、FCS掃描

FCS掃描工具將掃描本地或遠程文件系統(tǒng)的FCS文件。當(dāng)你想找到符合特定條件的FCS文件（污點協(xié)議、操作員ID、運行日期、機器等），或者當(dāng)FCS文件被移動并需要重新定位時，這個實用工具就很方便了。

7、影視

分析平臺獨特的軟件：查看你的數(shù)據(jù)動態(tài)。使用圖形窗口或布局編輯器電影來生成圖形作為時間的函數(shù)（動能分析），或者生成一個或兩個參數(shù)作為第三的函數(shù)的圖。這種獨特的可視化可以讓您發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)中的微妙關(guān)系，否則將不可能看到其他的關(guān)系。

8、板編輯

一個全新的平臺進行注釋，分組和組織板基于流式細(xì)胞儀檢測數(shù)據(jù)的元數(shù)據(jù)注釋工具板，進口板材快速標(biāo)注一個CSV文件，并能夠設(shè)置標(biāo)注滴定。

使用教程

如果你對不同的病人做相似的實驗，你可以保存一個工作區(qū)作為一個模板，包含所有的門、統(tǒng)計數(shù)據(jù)、表格和布局。下周，當(dāng)你和不同的病人做同樣的實驗時，大部分工作已經(jīng)為你做完了！您只需將新的示例導(dǎo)入模板工作區(qū)即可。良好的模板設(shè)計節(jié)省了大量的軟件分析時間和標(biāo)準(zhǔn)化報表。

1、將樣本加載到工作區(qū)中。

2、為相關(guān)的示例、門等創(chuàng)建組。

3、詳細(xì)分析單個示例，創(chuàng)建門戶、統(tǒng)計數(shù)據(jù)等。

4、對組中的所有樣本應(yīng)用適當(dāng)?shù)姆治觥?/p>

5、檢查組中樣品的澆口：易于修改樣品以適應(yīng)樣品變化。

6、生成一個圖形布局，您可以在其中顯示所有示例中的特定圖形。

7、生成一個表，您可以在其中創(chuàng)建所有樣本的特定統(tǒng)計信息。